Prvi dom z analizo odplak

Besedilo: Maja Bertoncelj
Kategorija: Medvode / torek, 8. december 2020 / 13:40  

Epidemiološka analiza odpadnih voda je komplementarni način spremljanja epidemije covida-19, ki ga opravlja Nacionalni inštitut za biologijo. Pod drobnogled so vzeli tudi odplake iz Centra starejših Medvode – kot prvi takšen primer.

Medvode – V DEOS Centru starejših Medvode so konec novembra zabeležili prvi primer okužbe z novim koronavirusom med stanovalci. Virus se je nato hitro širil, kar je bilo zaznati tudi iz rezultatov analize odpadnih voda.

Ob začetku analiz v domu še ni bilo okužbe

Nacionalni inštitut za biologijo je pred kratkim iz omenjenega centra starejših začel vzorčiti odplake. Gre za prvi tovrstni primer. Zakaj so izbrali ravno Center starejših Medvode, je pojasnila Katarina Bačnik iz Nacionalnega inštituta za biologijo: »Po posvetovanju z vodjo vladne strokovne skupine smo izbrali dom starejših, v katerem ni bilo okužbe, ko smo začeli opravljati analize.« Kot pravi, je spremljanje širjenja novega koronavirusa v populaciji prek odpadne vode lahko še posebno pomembno pri zaznavanju potencialnih novih izbruhov bolezni ter po postopni ukinitvi preventivnih ukrepov. »Vzorčenje odplak je možno tudi v posameznih ustanovah, kot so domovi za starejše, bolnice, zapori, študentski domovi. Domovi starejših so morda najpomembnejši, saj njihovi oskrbovanci spadajo v najbolj rizično skupino. Naše raziskave odplak iz Centra starejših Medvode kažejo, da smo potrdili virus v zelo veliki količini že en dan po tem, ko je prvi oskrbovanec začel kazati simptome bolezni.«

Rezultati so hitro na voljo

Pri odvzemu vzorcev v primeru Centra starejših Medvode sodeluje Čistilna naprava Domžale - Kamnik. Rezultati so znani hitro, kar je seveda pomembno. »V poletnem času zatišja pred okužbami smo imeli priložnost, da optimiziramo metode, uporabljene v analizah odpadne vode, in se s tem logistično pripravimo na jesenski drugi val okužb. Vzorce procesiramo v istem dnevu ali naslednji dan, kot jih vzorčimo, kar je seveda logistični in organizacijski zalogaj, zato pa so rezultati na voljo zelo hitro,« je pojasnila Bačnikova. Kot je dodala, gre za komplementarni način spremljanja epidemije – poleg spremljanja aktivno okuženih in podatkov o stanju iz bolnišnic. »Podatki se vključujejo v modele napovedovanja in pomagajo spremljati trende in učinkovitost ukrepov za preprečevanje širjenja virusa. Rezultati v odpadni vodi so zelo pomembni tudi, kadar so kapacitete kliničnih testiranj presežene oziroma pri zaznavanju potencialnih novih izbruhov bolezni po postopni ukinitvi preventivnih ukrepov.«

Ne glede na to, da analize odpadnih voda zaznajo prisotnost virusa, Bačnikova poudarja, da te nikakor ne morejo nadomestiti kliničnega testiranja prebivalstva, ki predstavljata osnovo za razumevanje poteka epidemije. »Po drugi strani pa klinična testiranja ne zajamejo vseh, denimo asimptomatskih okuženih ali pa ljudi, ki še ne kažejo simptomov oziroma so njihovi znaki bolezni blagi. V odpadni vodi pa je prisotnost virusa neodvisna od izbire in števila ljudi, ki jih vključimo v testiranje. Prednost pa je tudi v tem, da študije kažejo, da se SARS-CoV-2 v blatu okuženih ljudi pojavi zgodaj po okužbi, vemo pa, da do nastanka prvih znakov okužbe lahko traja dalj časa. S tem je spremembo trenda okuženosti mogoče z uporabo analize odpadnih vod zaznati nekaj dni prej, kot se zazna s testiranjem posameznikov.«

Ponekod počasen trend upadanja koncentracij

Prisotnosti virusov v vodi ni mogoče opaziti brez laboratorijskih analiz. »Virusi v odpadni vodi so pogosto prisotni v nizkih koncentracijah, zato jih moramo za uspešno detekcijo najprej skoncentrirati. Koncentriranju sledi izolacija nukleinskih kislin oziroma molekule RNA, saj gre v primeru novega koronavirusa za virus z genomom RNA. Nato sledi detekcija SARS-CoV-2 z uporabo metod, ki temeljijo na verižni reakciji s polimerazo oziroma reakciji PCR. Prav takšne metode se uporabljajo pri kliničnem testiranju za določanje okužbe iz brisa nosno-žrelne sluznice. V primeru odpadnih voda so pričakovane koncentracije virusa v začetku epidemije nizke, zato morajo biti metode še posebno občutljive in optimizirane za zaznavanje SARS-CoV-2 v odpadni vodi,« je še pojasnila Bačnikova.

V Nacionalnem inštitutu za biologijo sicer že dlje časa analizirajo tudi odpadne vode iz čistilnih naprav. »Rezultati so pokazali začetek naraščanja koncentracij v začetku oktobra, ki se je nadaljevalo vse do začetka novembra, ko je naraščanje koncentracij na večini čistilnih naprav doseglo plato. V zadnjih tednih ne opažamo bistvenega upada koncentracij virusnih nukleinskih kislin, te ostajajo relativno visoke. Na nekaterih lokacijah na Gorenjskem se kaže počasen trend upadanja koncentracij, medtem ko v Ljubljanski regiji ni zaznati večjega upada virusne RNA, prav tako so količine virusa še vedno visoke v nekaterih mestih Štajerske,« je za konec še povedala Bačnikova.